Родился в с. Медведском, в настоящее
время с. Гофицкое Петровского муниципального округа Ставропольского края. С
1929 г. трудился в сельхозкооперативе (позднее колхозе) «Пролетарская воля». По
окончании ветеринарных курсов в 1937 г. работал ветеринарным санитаром в том же
хозяйстве. Участник Великой Отечественной войны. Воевал на Западном и 4-м
Украинском фронтах, участвовал в обороне Москвы. В ноябре 1943 г. был ранен.
После демобилизации продолжил
работать в родном колхозе. В 1946 г. переехал в с. Калиновка Предгорненского
района Грозненской области, трудился в колхозе «Предгорный». С 1958 г. работал
в свиноводческом совхозе «Терек» в пос. Притеречный Чечено-Ингушской АССР. Приняв на откорм 300 голов свиней, довёл
показатели до 400 голов, затем до 500.
Указом Президиума Верховного Совета
СССР от 22.03.1966 г. за достигнутые успехи в развитии животноводства, увеличении
производства и заготовок мяса и другой продукции Я. И. Манаенко присвоено
звание Героя Социалистического Труда.
Награждён орденами Ленина,
Октябрьской Революции, Отечественной войны II степени, золотой медалью «Серп и
Молот».