Родился 17.06.1908 г. в г. Шуше (Азербайджан) в семье рабочего. Армянин. Член ВКП(б) с 1943 г. Окончил неполную среднюю школу.
В Красную Армию был призван в 1943 г. В 1944 г. окончил Ашхабадское военное пехотное училище. В боях Великой Отечественной войны с июня 1944 г. Командир взвода 1176-го стрелкового полка (350-я стрелковая дивизия, 13-я армия, 1-й Украинский фронт). Лейтенант Багиров с подразделением в бою 18.07.1944 г. отбил у гитлеровцев мост через р. Западный Буг в районе Кристинополья (Львовская область, Украина), обезвредил мины и фугасы, уничтожил до роты фашистов, 6 миномётов, орудие. При форсировании р. Сан 24 июля 1944 г. взвод захватил небольшой плацдарм и удерживал его до подхода основных сил. Одним из первых форсировал р. Висла и обеспечил прикрытие переправы.
Из наградного листа:
«18 июля 1944 г. при форсировании реки Западный Буг тов. Багирову со взводом автоматчиков (17 человек) была поставлена задача отбить у противника мост в районе м. Крыстынополь. Тов. Багиров в этом бою уничтожил до роты немцев, 6 минометов, 1 пушку, одновременно предотвратил взрыв железнодорожного моста, лично убил 6 немецких саперов и обезвредил заложенные фугасы, тем самым обеспечил переход наших танков и артиллерии по мосту.
При форсировании реки Сан 24 июля 1944 г. тов. Багиров со взводом в плавь переправился первым из всех через реку, продвинулся вперед на 800 метров и умело отражал контратаки противника, прочно удерживал плацдарм до подхода остальных сил полка, уничтожил при этом лично около 12 немецких солдат и офицеров. В бою за город Лежайск в тот же день он умело обошел противника с тыла и внезапным ударом способствовал успешному выполнению задачи. При форсировании реки Вислы 29.07.44 г. тов. Багиров также в числе первых переправился со взводом и обеспечил прикрытие переправы. 1 августа 1944 г. в бою за м. Капшевинца тов. Багиров со взводом отразил 9 контратак противника при поддержке бронетранспортеров и уничтожил своим взводом до 60 немецких солдат и офицеров, из них один майор.
За систематическое проявление личного героизма и военного мастерства достоин звания Героя Советского Союза».
Звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» (№ 7697) Багирову Рубену Христофоровичу присвоено Указом Президиума Верховного Совета СССР от 23 сентября 1944 года.
Награждён орденами Ленина, Красной Звезды, медалями. После войны находился в запасе. Жил и работал в г. Пятигорске Ставропольского края.
Умер 20 февраля 1978 г.
Почетный гражданин г. Кристинополь (Львовская область, Украина). Имя Героя установлено на памятном знаке в г. Червонограде Львовской области.