Родился в 1908 году в хуторе Любительском ныне Минераловодского района Ставропольского края. Русский. Работал в колхозе в селе Нагутском того же района. В Красной Армии с декабря 1941 г.
С мая 1943 года воевал на фронтах Великой Отечественной войны. Командир отделения 25-го гв. стрелкового полка (6-я гв. стрелковая дивизия, 13-я армия, 1-й Украинский фронт) гвардии сержант Колбаса отличился в ходе наступательных боев с 12 января по 1 февраля 1945 г. при форсировании р. Одер в районе г. Штейнау (Сьцинава, ПНР). Отделение во главе с Михаилом Ефремовичем, закрепившись на левом берегу реки, отразило контратаки противника и удержало позиции до подхода других подразделений.
Участвовал в Курской битве, битве за Днепр, освобождении Украины, Польши. Отличился во время Висло-Одерской операции. 12 января 1945 года отделение Колбасы переправилось через реку Чарна-Нида и захватило плацдарм на её западном берегу. Противник предпринял 4 контратаки, но все они были отбиты. Отделение уничтожило 55 вражеских солдат и офицеров.
Во время форсирования Одера в районе Штейнау М.С. Колбаса переправился на западный берег и отражал противника до подхода основных сил. В рукопашных схватках лично уничтожил 25 вражеских солдат и офицеров.
Звание Героя Советского Союза Колбасе Михаилу Ефремовичу присвоено 10 апреля 1945 года.
Награждён орденом Ленина, орденами Отечественной войны II ст., медалью «Золотая Звезда».
16 апреля 1945 года погиб в бою. Похоронен в населённом пункте Дёберн в 15 км от города Форст (Германия).
В 2016 г. по инициативе Регионального отделения Российского военно-исторического общества в Ставропольском крае на здании МКОУ гимназии №111 г. Минеральные Воды с. Нагутского Минераловодского района Ставропольского края была установлена мемориальная доска Герою Советского Союза М.Е. Колбасе.